Hotmail 打击了我的博客

四月 27, 2015

我的博客沉寂有一段时间了,原因相当诡异:大概从今年年初开始,我莫名其妙地无法接收到来自虚拟主机的邮件,用户有留言评论我都不知道。既然都变成“聋子”了,我怎么还有兴趣打理?

直到前几天我实在忍无可忍,向衡天小张主机创建服务工单求助。按道理创建工单之后我将会收到一封邮件,结果 hotmail 邮箱里面啥也没有。这下子我有点明白了:不是 WordPress 的问题,而是虚拟主机自身的问题:Hotmail 无法收到来自衡天小张主机的邮件。

更换为新浪邮箱之后,测试了一下,邮件功能正常,用户留下评论后可以收到邮件通知了。

请大家帮忙测试啦!使劲留言

玫瑰羊

二月 14, 2015

哈哈,折完后发现羊的四只脚没折齐,不尖。自我安慰一下:脚不尖才能站得稳嘛。
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哀外滩

一月 1, 2015

刚写完游西四海的日志之后,方才看到上海外滩的悲剧新闻,给上海的同学打电话确认平安之后才放心。

关于此次事故孰是孰非,网上已有太多评论,我不想对此妄作议论。跨入新年的朋友们,请慢下自己的脚步,平平淡淡的生活才是美。

元旦西四海之行

一月 1, 2015

北京故宫往西有六个湖,从北到南依次为西海、后海、前海、北海、中海和南海,不过最后两个的用途你知道的,不对外开放,所以只能游前四个。我是以徒步锻炼为主,游览为辅,仅半天时间就走完“西四海”了,当然如果边走边逛估计得一整天。
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密码子的简并性

十二月 15, 2014

“密码子简并”的概念在中学生物里就提过,即几个不同的密码子可以编码相同的氨基酸。但是密码子简并的规律之前却一直是模模糊糊的,趁这次刚完成类似的课题。趁热打铁总结一下:

首先,为了直观、方便地看密码子的简并,我们需要一张“环形密码子图”,而非通常教科书上的那种“方格形密码子表”。下面就是我常用的一张环形密码子图,它的核心由三个同心圆组成:由里到外分别表示第 1 位、第 2 位和第 3 位密码子,外圈是密码子编码的氨基酸及其理化特性。
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用bioperl计算比对的相似度

十二月 7, 2014

BioPerl 的比对模块(Bio::Align)中有三个方法用来计算比对相似度,它们分别是 percentage_identity,overall_percentage_identity 与 average_percentage_identity。

下面先以两条序列的比对为例,假设在文本文件 align.fasta 中放如下比对(FASTA 格式):


>seqA
CACAC--CCG
>seqB
CTCACATCCG

这个比对长10bp,第 2 位碱基不同,第 6、7 位还有 gap。下面来看这三个方法计算结果的差异:
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