iPad还是GoodReader看PDF电子书最方便

十一月 23, 2014

最近常在iPad上看PDF电子书,尝试过多看阅读、Adobe Reader 和 GoodReader等软件,感觉还是GoodReader 最方便,归结如下:

Adobe Reader:优点是轻巧,缺点是无法进行双面模式阅读,此外目录栏里面长的标题就显示不全了。

多看阅读:之前在 Android 平台上用过,优点是界面漂亮,可以双面模式阅读。缺点严重:复杂的 PDF 很难做标记,因为文字选择功能特别不灵敏。

GoodReader:具有 Adobe Reader 的完美功能,并且可以进行双面模式阅读。缺点是界面没中文,但无妨大碍,英文能看懂。此外软件收费,但最近以1元价格促销,很划算。

值得赞的是所有的阅读软件都可以调用iOS内置的词典进行查询,但是怎样扩充词典呢?目前内置词典内容有些单薄!

RSS悲剧的时刻到来了

十一月 13, 2014

自从Google Reader被墙之后,换到了鲜果网,现在悲剧的时刻到来了:

致鲜果RSS阅读器用户:

各位鲜果RSS阅读器用户,很遗憾的通知大家,鲜果团队将在2014年12月12日关闭RSS订阅服务。感谢大家长期以来的支持,希望大家理解我们的这一决定。

鲜果团队今后将更加专注于鲜果客户端的发展,为大家提供更优质的阅读体验。请到各大应用市场搜索“鲜果”或访问http://xianguo.com/apps下载鲜果客户端。

从即日起,RSS阅读器用户可以通过鲜果网导出自己的订阅数据,导出网址:http://xianguo.com/my/opml。用户以前收藏的文章还可以继续登录鲜果阅读。

如您希望继续使用其他RSS订阅服务,可参考罗昭锋老师的迁移教程 http://t.cn/R7gNUUP (同时提供视频 http://t.cn/R7gNUUv). 非常感谢罗昭锋老师!

谢谢!

鲜果团队

2014/11/12

接下来先考虑inoreader吧。试用一段时间后再来报告。

Windows perl处理中文

七月 29, 2014

最近在提分网做了一段时间的兼职,工作主要是试题校对,经常需要进行文本替换操作,纯手工操作特别麻烦,于是我就想到是否可以借助 Perl 的正则表达式功能来进行替换。但是以前工作中仅用 Perl 处理过纯英文的字符串,现在要面临的是中文字符串,或者中英文以及数学公式、标点符号混合字符串,而且还是在 Windows 平台上,Perl 能否胜任?

通常,最初测试 Perl 是否正常运行的语句是:

print "Hello, world\n";

那么,如果要测试它打印中文字符串,可以尝试:

print "你好!\n";

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BLASTN适用于极短的序列搜索的参数

七月 21, 2014

今天遇到一个小问题:需要搜索若干极短的DNA序列(不到20bp)的来源,首先想到的是BLAST,但是直接用默认参数肯定不行了。后来在某个大学的网站上找到了调整BLAST参数以适应极短的序列搜索的方法:

BLAST Parameters for short query sequences

For searching sequence similarities within very short fragments, BLAST may not be the best choice. If you want to tackle this anyhow, the word size should be reduced to the minimum, and the expectation value should be adjusted as well. Minimal settings for word size are -W 7 for blastn, and -W 2 for blastx in conjunction with reducing the neighborhood word threshold score to -f 8 or below (this is only necessary for blastx). Expectation value should be -E 100. Yes, that's no joke. When comparing against large databases like NT or NR, such high amounts of expected random hits have to be accepted. A lower eValue threshold could be used when only nearly exact matches are desired.

其实主要就是把-W 设成7.尝试过,1条8bp长的序列,就算是严格地在库中存在,如果只用默认参数,啥也搜不到。如果加上-W 7,就可以搜到。

但是第一句话已经给出了警告:对于这样的搜索,其实BLAST并不是最好的选择。究竟有什么更合适的呢?

博客未死,坚持到2024年!

六月 25, 2014

今天给域名续费了(7月1号以后要涨价了)。2024年6月19日,好遥远的日子啊!希望到那个时候我已经过上小老百姓的日子。🙂

母亲节小记

五月 11, 2014

算起来我离开家乡读大学到现在已经有8年了。刚开始,在外地感觉挺新鲜,每过几天就时不时地给妈打电话。后来新鲜味过去了,再加上课业繁忙,往往连续几周都没怎么跟家里联系。

直到去年暑假没回家,却回家过了次中秋——七年来第一次回家过中秋,虽然也只呆了短短一周,那感觉却很不一样了。

那段时间做失败了一个课题,心里郁闷,就宅在宿舍找些老时代的电影来看,多是小时候看过一眼或听过但没细看全部情节的片子,现在回忆起来它们都是经典中的经典,尽管全是港台片。这里面有95年的《金玉满堂》、94年的《新少林五祖》、《九品芝麻官》、92年的《新龙门客栈》,还有一个更古老的,88年的《妈妈再爱我一次》,在我出生之前。
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