NCBI prefetch下载SRA

十二月 12, 2019

基本格式

prefetch --max-size 100G -O ./ SRAXXXX
或者
prefetch --max-size 100G -O ./ --option-file SraAccList.txt

注意:

  1. --max-size默认只有20G,所以要改
  2. 不要去添加-a、-t这些参数,现在即使ascp安装在家目录,prefetch也能识别。添加了反而出错
  3. -O ./ 表示下载到当前目录,否则默认会下载到家目录下面的ncbi文件夹
  4. 不是所有的文件都能使用ascp下载。参见链接

posted in Biology Science, Science by billzt

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